SYMPLEX是什么？
SYMPLEX 是由北京大學錢瓏團隊發布的功能基因深度挖掘大模型平臺，專為生物制造和合成生物元件設計服務。平臺結合大語言模型能力與結構化生物知識，能夠從海量文獻中自動提取與標注功能基因，并提供基因功能推薦、結構分析與知識圖譜生成等功能，推動從序列到應用的基因資源發現。
SYMPLEX 的主要功能
- 文獻智能提取（PubEngine）：支持千萬級生物學文獻的高通量語義解析與檢索，自動提取基因與功能關聯。
- 基因功能標注（GeneTagger）：通過自然語言處理與生物信息算法，從文獻中提取細粒度分子機制與生物過程信息。
- 標準化知識對齊（GeneNorm）：將提取信息與專家知識庫對齊，構建系統化“功能基因知識樹”與關聯模式。
- 跨物種基因挖掘：支持從不同物種基因組中挖掘稀有酶種與功能元件，如高性能 mRNA 加帽酶。
- AI 驅動的基因推薦：提供可直接用于疫苗、代謝通路、合成元件設計的候選基因集合與變體組合。
SYMPLEX 的適用場景或人群
- 合成生物學研究人員：快速獲取可工程化的功能基因，輔助通路設計與酶優化。
- 生物制造企業與藥企：用于發掘疫苗、蛋白藥、底物轉化等關鍵催化酶資源。
- AI for Science 研究者：研究 LLM 在結構知識提取、因果鏈生成、生物信息集成中的應用能力。
- 生命科學開發者：對接基因設計平臺、圖譜引擎、蛋白生成系統，實現從知識到應用閉環。
如何使用 SYMPLEX
SYMPLEX 提供在線交互式平臺（https://bdainformatics.org/page?type=SYMPLEX），支持用戶注冊后免費使用。平臺采用模塊化設計，支持獨立調用或集成分析，適用于科研實驗、數據分析和酶資源發掘等實際場景。
論文發表期刊：Science Advances
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